En una derivación biliopancreática con cruce duodenal, se extirpa una porción del estómago, pero el píloro permanece intacto. El píloro controla el drenaje de los alimentos del estómago. El píloro se conecta con un segmento más bajo del intestino. El duodeno se conecta con la parte inferior del intestino delgado. Entonces, la comida que ingiere sortea gran parte del intestino delgado. Esto resulta en una menor absorción de calorías y pérdida de peso.